Is there a separate word relevant for tsarist period gymnasium student, similar to modern "отличник"?
My answer is No. There wasn't a single grading system in Tsarist Russia such as 1-5 in Soviet times. There were many different academic grading approaches, as it is described here:
В начале второй половины XIXвека в России в разных типах средних
учебных заведениях параллельно сосуществовали пятибалльная и
12-балльная системы оценок. Кроме того, в начальной школе, учительских
учебных заведениях, некоторых новаторских средних школах баллов вообще
не было (например, в гимназиях Гавловского, Спешневой, Оболенской,
позднее – Стюининой в Петербурге, некоторых других) [12]. В разных
учебных заведениях и в разных странах использовали двухбалльную
(зачтено, не зачтено), 60- балльную, 100-балльную системы. В некоторых
случаях вместо цифровых баллов использовали сжатые ("отлично",
"хорошо", "удовлетворительно", "неудовлетворительно", "абсолютно
неудовлетворительно" или "плохо") или развернутые словесные
характеристики. Во французской школе практиковалось установление
определенного рейтинга среди учеников: первый ученик класса или по
какому-то предмету; второй, третий.… В ряде заграничных католических
женских школах для привлечения учениц использовали разные ленты,
жетоны. А в десятках российских школах существовали красные и черные
доски уважения и унижения фамилий лучших и худших учеников. Таким
образом, во времена, когда в Петербургском педагогическом товариществе
происходила дискуссия о школьной оценке, однозначных взглядов на нее
ни мировая педагогическая теория, ни школьная практика не произвели.
Apparently, grading was and still is a subject of discussion, and many different approaches were tried during the past 200 years.
Also see Education and the State in Tsarist Russia By Patrick L. Alston here, which states that the Ministry of Education installed "ballovaya systema" with grades 1 through 5 throighout the empire, and that in conversation the teachers would call students: a "two", a "three" or a "five".
So, it doesn't seem to be true to say that Russian had 1-12 grading system, and that there was a word for pupils getting 12. If anything there was a familiar 1-5 "ball" system, or a variety of different systems, and there was unlikely a common name of the best students.